Gebeliğin ilk 3 ayında veya bir defaya mahsus görülen düşüklerin sık görülmesinin sebebi, kromozom bozukluklarıdır. Bu bozukluklar döllenme aşamasında gelişir. Kromozomların fazla olması ya da eksik genler bebeğin gelişimini durdurabilir. Özellikle 35 yaş sonrası gebeliklerde düşük riski daha fazladır.